Podstrona trzecia
Yamaha R1 2004
| 
| Odsłony: 64
Wraz z rozwojem konkurencji, Yamaha wprowadziła kilka istotnych zmian w modelu. Obejmowały one aktualizacje styli, takie jak podwójny układ wydechowy pod siedzeniem i ulepszenia wydajności, w tym hamulce promieniowe, a także po raz pierwszy wlot R1-Ram.
Yamaha R1 2005
| | Odsłony: 52
Rok 2005 R1 waży 172 kilogramy (379 funtów) na sucho. Konwencjonalne zaciski hamulca przedniego zostały zastąpione promieniowo zamontowanymi suwmiarkami aktywowanymi przez promieniowy cylinder główny. W tym roku dodano także zamontowany fabrycznie tłumik układu kierowniczego.
Yamaha R1 2006
| | Odsłony: 59
W roku 2006 wahacz został przedłużony o 20 milimetrów (0,79 cala), aby zmniejszyć niestabilność przyspieszenia. W tym roku Yamaha wydała także limitowaną wersję w oryginalnych kolorach wyścigowych Yamaha, aby świętować 50-lecie powstania.